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情報生命物理学研究室

Intelligent Bio-Soft Matter Physics & Molecular Computing Group
ーExploring Chemical Artificial Intelligence and Artificial Life-like Systems

生命システムは化学エネルギーで駆動する自律的な分子コンピュータ・分子マシンであると考えられます。当研究室では、生体分子の構造や非平衡な分子反応をプログラムすることで化学的人工知能自律的に動く知的な人工生命システムを実現する、情報生命物理学を開拓しています。

Life systems can be described as autonomous molecular computers or machines that use chemical energy. Our group is pioneering a new field of biophysics to realize Chemical Artificial Intelligence (Molecular Computers) and Autonomous Intelligent Artificial Life-like Systems through programming biomolecular structures and non-equilibrium molecular reactions.

情報・生命・物理が紡ぐ、知性をもつ物質への挑戦

生き物も、道端の石のような無生物も、どちらも同じ「物質」からできています。しかし、生き物には驚くべき特徴があります。それは、自らの設計図である遺伝情報をもとに、自ら体を作り上げることです。また、暑くなれば汗をかくように、周囲の状況に合わせて自ら変化します。さらに、筋肉組織では、多数の筋細胞が協力して収縮することで、個々の細胞だけでは不可能な「体を動かす」という大きな力を生み出します。脳では、神経細胞が電気的な信号をやり取りすることで、自ら思考することも可能です。植物は、光エネルギーを利用して栄養を作り出すことができます。これらの高度な機能は、生き物がエネルギーを消費しながら、ある種の情報を処理しているからこそ実現できるのです。

より専門的に表現するならば、生物の特徴は、遺伝情報に基づいて自己組織的に体を構築したり、周囲の環境に自律的に適応したり、互いに相互作用しながら集団として高次の機能を創発したりする点にあります。これらの機能は、「非平衡系」と呼ばれる、物質とエネルギーの流れを利用した動的なシステムにおいて、ある種の情報処理(計算)が行われていると捉えることができます。つまり、生物とは、自律的に「計算」を行うことで賢く振る舞う特別な物質であると言えるでしょう。生物とは、自律的な分子コンピュータや分子マシンのようなものなのです。

物質科学と情報科学が飛躍的に進歩した現代において、まるで生き物のように情報を処理して、賢く振る舞う「知的物質」という新しい材料への期待が高まっています。しかし、このような物質を深く研究するには、物理学、情報科学、生命科学といった従来の学問分野の知識だけでは不十分です。そこで、私たちの研究室では、これらの分野を融合させ、「知的物質」を専門的に扱うための新しい学際的な科学領域を切り拓くことを目指し、多様な研究に取り組んでいます。

これらの研究を通して、私たちは、「生命とは何か?」という根源的な問いに対し、物理学や情報科学の視点からアプローチを試みています。化学エネルギーを使って情報を処理し、自律的に動いたり、思考したりできる分子の集合体に関する新しい科学、情報生命物理学を構築しようとしています。そして、分子コンピューティングや人工生命工学のような革新的な科学技術を開拓したいと考えています。このような基礎研究は、将来的に、医療、環境、エネルギーなど、様々な分野で役立つ技術へと繋がることが期待されます。

   

化学的人工知能のための分子コンピューティング

生命システムは、最適な状況を見つけ出したり、複雑なパターンを自ら作り出したりします。これらの現象は、生命が自律的に情報を処理し、化学反応を使ってある種の「計算」を行っていると捉えることができます。ここでは、DNAなどの生体分子や液体といった「物質」そのものを使い、ナノスケールで計算を実現する「分子コンピューティング」や「分子プログラミング」といった新しい計算原理を探求しています。物質と情報を融合した新しい生物物理学を開拓します。分子コンピュータは、物理や化学の法則に基づいて分子を直接操作し計算を行うため、将来的には医療や環境問題の解決など、幅広い分野への応用が期待されています。
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適応・進化する人工細胞の合成生物学と医薬・環境応用

生命が、非生命の物質からどのように作られ、知性を持つようになったのか。これは科学における大きな謎の一つです。この根源的な問いに迫るため、私たちは「人工細胞」や、環境に適応し進化する能力を持つ「人工生命システム」を実際に創り出す、合成生物学の研究を進めています。DNA、RNA、タンパク質、脂質等を用いて、脂質膜小胞型やコアセルベート型(液-液相分離型)の人工細胞を構築しています。さらに、自律的に働く免疫細胞のような細胞型分子ロボットなどの構築を通して、医薬・環境応用も目指しています。
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人工知能やロボットを使った自律的な物質・生命科学

近年、人工知能(AI)技術を活用した、分子実験を自動で行うための実験アルゴリズムやロボットシステムが注目されています。DNAのような生体高分子は、その配列自体が情報としての意味を持つため、情報技術との相性が良く、AIによる自動化といった新しい実験スタイルに非常に適しています。この研究では、こうしたAI技術などをさらに発展させ、分子コンピュータや人工細胞を自律的に生成する技術の開発を目指しています。
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知的なソフトマターの物理・化学

エネルギーや物質、情報が絶えず出入りする「非平衡開放系」で、情報を持つ「やわらかい物質(ソフトマター)」が、まるで生き物のように自ら秩序だった構造やパターンを作り出す「自己秩序化」という現象を探求しています。これは生命システムの複雑な振る舞いを物理学の視点から捉え直す試みです。具体的には、電場・光等による非平衡場のエネルギーや、化学反応による分子の自由エネルギーの変換によって、計算、記憶、自律的な運動、集団での連携といった知的な機能を持つ「アクティブマター」を創り出し、その物理的な仕組みを解明します。これらの知見を、マイクロマシンやソフトロボットにも応用していきます。
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東京科学大学 (Institute of Science Tokyo)
 総合研究院 自律システム材料学研究センター (ASMat)
 生命理工学院 生命理工学系 生命理工学コース/人間医療科学技術コース/物質・情報卓越コース
 工学院 システム制御系 システム制御コース
 情報理工学院 情報工学系 人間医療科学技術コース

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  • 見学等連絡先:瀧ノ上(takinoue [at] comp.isct.ac.jp)
  • ◯学外から当研究室の学振PDを検討している方:不採択でも、科研費での雇用後、再チャレンジでの採択実績多数
  • ◯生命理工学院生命理工学系,工学院システム制御系 修士課程・博士課程大学院生(情報系に限らず,物理学,生命科学,化学などの大学院生も求む)
  • ◯博士課程学生の給付型経済的サポート有り:学振DCJST次世代研究者挑戦的研究プログラム、研究室の科研費等のRA/TA、つばめ博士学生奨学金物質・情報卓越コース、MEXT Scholarshipなど
    ※修士課程で学内生でも学外生でも、入進学前から東京科学大に申請し、博士課程入学後すぐにスタートできる学内奨学金があります
  • ◯国際経験サポート充実:ASPIREプロジェクトによるUK研究留学(Cambridge, Imperial College London)、国際会議への参加・発表の機会、短期海外留学の機会、学内の国際ハブ組織で研究
  • ◯その他実績:修論→筆頭著者投稿論文多数、院生は学会賞多数受賞、学振DC/PD比率高
  • ◯研究スタイル:自由度高(卒論・修論・博論研究題目
世界を変えたい異端児募集!
  • ◯化学物質で人工知能を作りたい化学者・物理学者
  • ◯生命システムを凌駕するシステムを作りたい生命科学者
  • ◯ウェット実験でナノサイズの新しいコンピュータを作りたい物理学者・情報工学者
  • ◯自然はすなわち計算だと思う情報科学者
  • ◯熱力学・統計力学に基づくナノコンピュータを作りたい物理学者・情報工学者
  • ◯生命システムをコンピュータでシミュレート/デザインしたい情報工学者
  • ◯知能を持った細胞のような柔らかいロボットを作りたい制御工学者
  • ◯生命の神秘の物性を感じたい物理学者
  • ◯DNAの構造は自然の芸術だと思う化学者

研究室の解説記事

日本語解説記事
    • ◯”DNAから人工細胞や分子ロボットをつくる-物質と生命の境界を探求-”, NEXT generation, 東京工業大学 Link (日本語) / “Creating artificial cells and molecular robots using DNA – Exploring the boundary between matter and life”, NEXT generation, Tokyo Tech: Link (English) 
    • ◯”天然にないものの生物物理学”, 「生物物理」誌, 巻頭言 (2020) DOI: 10.2142/biophys.60.263 [The Biophysics of ʻOrganisms Not Existing in Natureʼ (English translation)]
    • ◯”生体内で働く分子ロボットの実現へ:情報媒体としてのDNA分子とDNAコンピューティング”, 情報管理(JST) (2017) DOI: 10.1241/johokanri.60.629
    • ◯”自律性を備えた人工細胞を創出し、生命と物質の境界を探る”, Nature Digest (2012) DOI: 10.1038/ndigest.2012.120226
プレスリリース記事

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瀧ノ上(takinoue [at] comp.isct.ac.jp)